Sezóna 2006/2007 byla čtrnáctým ročníkem české hokejové soutěže. Extraligy i 1. ligy se zúčastnilo po 14 týmech. V tomto ročníku se baráž přímo nehrála.
Sezóna 2006/2007 byla zajímavá především v jedné věci. Žádný tým nesehrál baráž, jelikož klub Vsetínská hokejová byl vyloučen z extraligy a místo nich se do extraligy dostal tým HC Slovan Ústí nad Labem, který v 1. lize přehrál ve finále Chomutov (3:2 na zápasy).
6. června 2007 rozhodla Asociace profesionálních klubů ledního hokeje, že klubu neudělí licenci a bude z extraligy vyloučen. Důvodem bylo vysoké zadlužení klubu. Arbitrážní komise 20. srpna 2007 rozhodla, že Vsetín byl z extraligy vyloučen oprávněně a nevyhověla žádosti, aby byl zařazen zpět do nejvyšší soutěže. Podle soutěžního řádu mohl tak tehdejší šestinásobný mistr Vsetín hrát pouze krajský přebor. Vsetín byl vyloučen z důvodu neplnění a porušení povinností stanovených valnou hromadou APK a navíc tým nenaplnil povinnost uhradit veškeré finanční závazky včas. Vsetín nakonec až pro sezónu 2008/2009 odkoupil licenci na 2. ligu od Blanska.
