Sezóna 2005/2006 byla třináctým ročníkem české hokejové soutěže. Extraligy i 1. ligy se zúčastnilo po 14 týmech. Do hry o baráž se z extraligy dostal tým Vsetínská hokejová Z 1. ligy se do baráže šel tým HC Slovan Ústí nad Labem.
V rámci extraligy se čtrnáct týmů zúčastnilo čtyřkolového herního systému, v rámci kterého nastoupil každý s každým. Celek, který skončil na posledním čtrnáctém místě, sehrál baráž s nejlepším celkem, jenž vyhrál 1. ligu. Baráž se hrála na čtyři vítězná utkání.
| Zápas | Tým | Tým | Výsledek |
| 1. | Vsetínská hokejová | HC Slovan Ústí nad Labem | 0:2 |
| 2. | Vsetínská hokejová | HC Slovan Ústí nad Labem | 4:1 |
| 3. | HC Slovan Ústí nad Labem | Vsetínská hokejová | 3:1 |
| 4. | HC Slovan Ústí nad Labem | Vsetínská hokejová | 2:3sn |
| 5. | Vsetínská hokejová | HC Slovan Ústí nad Labem | 2:1 |
| 6. | HC Slovan Ústí nad Labem | Vsetínská hokejová | 0:1 |
Vsetínská hokejová uhájila svojí účast do dalšího ročníku extraligy, zatímco klub HC Slovan Ústí nad Labem dále setrval v 1. lize.